PubMed: Eine kostenlose biomedizinische Literaturdatenbank

PubMed: Eine kostenlose biomedizinische Literaturdatenbank 162

Eine kostenlose Online-Datenbank, die vom National Center for Biotechnology Information (NCBI) der U.S. National Library of Medicine (NLM) entwickelt wurde und sich auf Literaturrecherche und Abstract-Dienste im biomedizinischen Bereich konzentriert.

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PubMed: Eine kostenlose biomedizinische LiteraturdatenbankEinführung

PubMed ist eine kostenlose Online-Datenbank, die vom National Center for Biotechnology Information (NCBI) der US National Library of Medicine (NLM) entwickelt wurde und sich auf Literaturrecherche und Abstractdienste im Bereich Biomedizin konzentriert. PubMed enthält hauptsächlich Zeitschriftenartikel, Konferenzbeiträge, Dissertationen und Ähnliches aus den Bereichen Medizin und Lebenswissenschaften. Zu den abgedeckten Zeitschriften gehören das „New England Journal of Medicine", „The Lancet", „Nature Medicine" und weitere.

PubMed bietet nicht nur eine Literaturrecherche, sondern unterstützt auch zahlreiche Suchoptionen, darunter die erweiterte Suche und klinische Abfragen, um Nutzern zu helfen, relevante Forschungsartikel schnell zu finden. Nutzer können nach Stichwörtern, Autoren oder Artikeltiteln suchen, und das System stellt Filter zur Verfügung, um die Suchergebnisse zu präzisieren.

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Suchtipps und Funktionen von PubMed:

PubMed bietet mehrere Suchmethoden, darunter die einfache Suche, die erweiterte Suche und die MeSH-Schlagwortsuche. Nutzer können nach Stichwörtern, Autoren, Zeitschriftennamen, Veröffentlichungsdaten und weiteren Kriterien suchen und boolesche Operatoren (AND, OR, NOT) sowie Trunkierungszeichen verwenden, um die Suchergebnisse zu optimieren. Die Details sind wie folgt:

  • Einfache Suche: Nutzer können durch die Eingabe von Stichwörtern schnell Literatur finden. PubMed führt automatisch einen Wortabgleich und eine Umwandlung durch, aber Nutzer können auch doppelte Anführungszeichen verwenden, um eine exakte Phrasensuche zu erzwingen und so die Genauigkeit zu erhöhen.

  • Erweiterte Suche: Für komplexere Abfragen bietet PubMed eine erweiterte Suchoberfläche, die es Nutzern ermöglicht, Suchbegriffe auf bestimmte Teile eines Artikels (z. B. Titel, Abstract) zu beschränken, mehrere Bedingungen mit logischen Operatoren (AND, OR, NOT) zu kombinieren und den Suchverlauf für komplexe Kombinationen zu nutzen.

  • Phrasensuche: Die Verwendung doppelter Anführungszeichen um eine Stichwortgruppe stellt sicher, dass PubMed diese als zusammenhängende Phrase behandelt und reduziert irrelevante Ergebnisse.

  • Suche nach Autoren und Titeln: Nutzer können direkt nach dem Namen eines Autors oder dem Titel eines Artikels suchen, was besonders nützlich ist, um die Arbeit bestimmter Autoren oder bereits bekannte Literatur zu finden.

  • PubMed Central (PMC): Obwohl PubMed hauptsächlich Abstracts bereitstellt, können Nutzer über Verlinkungen zu PubMed Central eine große Anzahl kostenloser Volltexte aus der biomedizinischen Literatur finden.

  • Zeitliche Filterung: Nutzer können den Zeitraum der Veröffentlichung festlegen, um aktuelle Forschungsergebnisse zu konzentrieren oder historische Literatur durchzusehen.

  • Automatischer Wortabgleich und MeSH-Begriffe: PubMed verwendet das Medical Subject Headings (MeSH)-Vokabular, um Suchanfragen zu standardisieren. Selbst wenn keine MeSH-Begriffe eingegeben werden, versucht das System, diese in Standardbegriffe umzuwandeln, um die Sucheffizienz zu verbessern.

  • Plugins und Tools: Erfahrene Nutzer können die API von PubMed oder Drittanbieter-Plugins (z. B. neue Funktionstests in PubMed Labs) nutzen, um das Sucherlebnis individuell anzupassen.

  • Literatur exportieren und speichern: PubMed bietet Optionen zum Exportieren von Literatur als Textdatei, in Referenzmanagementsoftware-Formaten (wie EndNote, RefWorks) sowie zum Versenden per E-Mail. Nutzer können außerdem ein eigenes PubMed-Konto erstellen und Literatur in persönlichen Favoriten speichern.

Wie nutzt man PubMed-Plugins, um die Suche zu optimieren?

Scholarscope:

Funktion: Dieses Plugin ergänzt die PubMed-Oberfläche um Informationen wie den Impact Factor (IF), die CAS-Zoneneinteilung und die Anzahl der Zitationen. Es unterstützt das Herunterladen von Volltexten mit einem Klick (über SCI-hub) und ermöglicht den Export von Literatur nach Endnote.

Installation und Nutzung:

  • Installieren Sie das Plugin in Firefox oder Chrome.

  • Nach der Installation wird neben jedem Artikel auf PubMed der IF der Zeitschrift angezeigt. Über die Einstellungen können außerdem die JCR-Zoneneinteilung und die Anzahl der Zitationen eingeblendet werden.

  • In den Einstellungen kann eine SCI-hub-Adresse konfiguriert werden, um Volltexte schnell herunterzuladen.

  • Artikelabstracts können direkt geladen und Literaturinformationen in die Referenzverwaltungssoftware exportiert werden.

Tampermonkey (in Verbindung mit Scholarscope):

  • Hilfswerkzeug: Dient zur Installation und Verwaltung von Userscripts wie Scholarscope und erweitert die Browserfunktionen.

  • Bedienung: Installieren Sie Tampermonkey als Browsererweiterung und nutzen Sie es, um Skripte wie Scholarscope zu installieren und zu verwalten.

Easy PubMed und easyScholar:

  • Merkmale: Bieten Informationen zur Zoneneinteilung der Zeitschrift, zum Impact Factor und zur Anzahl der Zitationen. Sie unterstützen das Herunterladen von PDFss über SCI-HUB mit einem Klick sowie die Literaturverwaltung und Erstellung von Zitationsformaten.

  • Installation: Unterstützt Edge und Google Chrome und wird über den Erweiterungs-Shop des jeweiligen Browsers installiert.

  • Nutzung: Nach der Installation zeigen die Suchergebnisse vielfältigere Informationen, was das schnelle Filtern wichtiger Literatur erleichtert. Außerdem können Literatur direkt verwaltet und heruntergeladen werden.

Selbstentwickelte Plugins oder Erweiterungen:

  • Technisch versierte Nutzer können eigene JavaScript-Skripte entwickeln oder vorhandene nutzen und diese über den Entwicklermodus des Browsers in PubMed integrieren, um individuelle Funktionen wie das automatische Laden weiterer Ergebnisse oder eine optimierte Oberflächendarstellung zu realisieren.

Seit 1997 stellt PubMed Nutzern weltweit Dienste zur Verfügung. Der Kerninhalt stammt aus MEDLINE, ist jedoch nicht darauf beschränkt, sondern umfasst auch PreMEDLINE, OldMedline sowie direkt von Verlagen bereitgestellte Zitationen. Der Literaturbestand von PubMed ist umfangreich und umfasst über 4.000 Zeitschriften aus mehr als 70 Ländern und Regionen seit 1966, mit einer Gesamtzahl von über 37 Millionen Einträgen.

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